一、項(xiàng)目編號(hào)：GZGK**P**8C****Z
二、項(xiàng)目名稱：水稻種質(zhì)資源DNA分子指紋圖譜庫構(gòu)建
三、采購結(jié)果
合同包2(稻屬種質(zhì)資源基因組測試服務(wù)):
| 供應(yīng)商名稱 | 供應(yīng)商地址 | 中標(biāo)（成交）金額 |
|---|---|---|
| 杭州鏈康醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 | 浙江省杭州經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)白楊街道6號(hào)大街**0號(hào)1幢2樓西 | **0,**0.**元 |
四、主要標(biāo)的信息
合同包2(稻屬種質(zhì)資源基因組測試服務(wù)):
服務(wù)類（杭州鏈康醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司）
| 品目號(hào) | 品目名稱 | 采購標(biāo)的 | 服務(wù)范圍 | 服務(wù)要求 | 服務(wù)時(shí)間 | 服務(wù)標(biāo)準(zhǔn) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2-1 | 其他自然科學(xué)研究和試驗(yàn)開發(fā)服務(wù) | 稻屬種質(zhì)資源基因組測定 | 完成野生稻種質(zhì)資源基因組重測序 | 1、樣本運(yùn)送和提取質(zhì)檢 （1）送檢樣品為水稻組織，需供應(yīng)商需上門取樣，采用干冰運(yùn)輸。 （2）DNA提取：基于磁珠吸附法對(duì)樣本進(jìn)行DNA提取，并進(jìn)行DNA濃度檢測，樣品DNA總量不低于2μg，核酸濃度≧**ng/μL。 （3）DNA質(zhì)檢：通過瓊脂糖凝膠電泳成像系統(tǒng)評(píng)估DNA質(zhì)量，要求條帶清晰，無RNA/蛋白污染，篩選符合試驗(yàn)要求的高質(zhì)量DNA，用于后續(xù)建庫測序，并進(jìn)行文庫質(zhì)檢保證文庫質(zhì)量。 2、數(shù)據(jù)測序和質(zhì)控 （1）測序平臺(tái)：采用高通量二代或三代測序平臺(tái)開展測序； ▲（2）平均每個(gè)個(gè)體數(shù)據(jù)量達(dá)到** Gb cleandata； ▲（3）質(zhì)控后所有序列的每個(gè)堿基的質(zhì)量值（-**log**(error P)，其中P為Phred質(zhì)量評(píng)分）大于**；質(zhì)控后重復(fù)序列在所有序列中占比不超過**%；質(zhì)控后基因組比對(duì)率≥**% | 合同簽訂之日起 ** 天內(nèi)完成 | 嚴(yán)格按照招標(biāo)文件中的各項(xiàng)要求執(zhí)行 |
| 2-2 | 其他自然科學(xué)研究和試驗(yàn)開發(fā)服務(wù) | 基因組遺傳多樣性以及泛基因組分析 | 完成基因組遺傳多樣性以及泛基因組分析 | 1、數(shù)據(jù)分析和交付 （1）原始數(shù)據(jù)質(zhì)控和比對(duì)分析：測序質(zhì)量原始統(tǒng)計(jì)、比對(duì)參考基因組統(tǒng)計(jì)（含覆蓋度、dup%、比對(duì)率等）、樣本的全基因組覆蓋深度階梯圖、染色體的平均覆蓋深度等。 （2）變異檢測分析（包括SNP，InDel，SV和CNV）：SNP/InDel原始突變注釋信息（VCF格式）、SNP和InDel所在位置分類及注釋信息、全基因組SNP/InDel變異位點(diǎn)密度分布、結(jié)構(gòu)變異SV檢測（VCF格式）和注釋、拷貝數(shù)變異（CNV）檢測和注釋等。 （3）GWAS分析：系統(tǒng)發(fā)育樹、群體結(jié)構(gòu)分析、主成分分析、親緣關(guān)系分析、性狀關(guān)聯(lián)分析、單倍型分析等。 （4）泛基因組分析：核心基因組、可變基因組、泛基因組曲線分析、泛基因組可視化和比較基因組學(xué)分析 | 合同簽訂之日起 ** 天內(nèi)完成 | 嚴(yán)格按照招標(biāo)文件中的各項(xiàng)要求執(zhí)行 |
五、評(píng)審專家（單一來源采購人員）名單：
張威、李春生、王代容、巫光宏、李晨（采購人代表）
六、代理服務(wù)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)及金額：
| 代理服務(wù)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn) | 本項(xiàng)目的招標(biāo)代理服務(wù)費(fèi)收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)以各采購包的采購預(yù)算金額為計(jì)算基數(shù)根據(jù)招標(biāo)代理機(jī)構(gòu)官網(wǎng)（http://www.gzgkbidding.com/index.php?m=Home&c=News&a=detail&id=**）規(guī)定的收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)按服務(wù)采購類型進(jìn)行計(jì)算收取，計(jì)算后不足****元按****元收取。 | ||
|---|---|---|---|
| 合同包號(hào) | 合同包名稱 | 代理服務(wù)費(fèi)金額（萬元） | 收取對(duì)象 |
| 2 | 稻屬種質(zhì)資源基因組測試服務(wù) | 0.8 | 中標(biāo)（成交）供應(yīng)商 |
七、公告期限
自本公告發(fā)布之日起1個(gè)工作日。
八、其他補(bǔ)充事宜
合同包2(稻屬種質(zhì)資源基因組測試服務(wù)):
| 供應(yīng)商 | 資格性審查 | 符合性審查 | 技術(shù)得分 | 商務(wù)得分 | 價(jià)格得分 | 綜合得分 | 得分排名 | 推薦排名 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 杭州鏈康醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 | 通過 | 通過 | **.** | **.** | **.** | **.** | 1 | 1 |
| 北京泰優(yōu)安華生物技術(shù)有限公司 | 通過 | 通過 | **.** | **.** | 9.** | **.** | 2 | 2 |
| 廣州基迪奧生物科技有限公司 | 通過 | 通過 | **.** | 8.** | 8.** | **.** | 3 | |
| 廣東美格基因科技有限公司 | 通過 | 通過 | **.** | 4.** | 9.** | **.** | 4 |
九、凡對(duì)本次公告內(nèi)容提出詢問，請(qǐng)按以下方式聯(lián)系。
1.采購人信息
名 稱：廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水稻研究所
地 址：廣州市天河區(qū)金穎東一街3號(hào)
聯(lián)系方式：**0-********
2.采購代理機(jī)構(gòu)信息
名 稱：廣州市國科招標(biāo)代理有限公司
地 址：廣州市先烈中路**0號(hào)科學(xué)院大院9號(hào)樓東座2樓（中國廣州分析測試中心對(duì)面）
聯(lián)系方式：**0-********、**0-********
3.項(xiàng)目聯(lián)系方式
項(xiàng)目聯(lián)系人：謝學(xué)超、吳秋娜
電 話：**0-********、**0-********
廣州市國科招標(biāo)代理有限公司
****年**月**日
